Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPT1P50897 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPT1P50897 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPT1P50897 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms