Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK2P49760 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLK2P49760 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLK2P49760 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK2P49760 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK2P49760 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK2P49760 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK2P49760 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK2P49760 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms