Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms