Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UTRNP46939 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UTRNP46939 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UTRNP46939 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UTRNP46939 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UTRNP46939 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UTRNP46939 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UTRNP46939 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms