Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHKA1P46020 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHKA1P46020 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms