Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPOP42166 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPOP42166 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPOP42166 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPOP42166 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms