Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT2P35908 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT2P35908 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT2P35908 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT2P35908 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT2P35908 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT2P35908 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT2P35908 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms