Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC4P35249 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC4P35249 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC4P35249 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC4P35249 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC4P35249 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC4P35249 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC4P35249 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms