Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM4P33991 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM4P33991 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM4P33991 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms