Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA9P31269 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms