Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD3P31249 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD3P31249 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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