Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR2AP28223 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms