Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL3RAP26951 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms