Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO1P25800 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO1P25800 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMO1P25800 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMO1P25800 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms