Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRDP23468 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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