Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCP20941 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCP20941 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCP20941 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCP20941 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCP20941 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCP20941 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCP20941 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms