Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4BPBP20851 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4BPBP20851 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms