Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A1P19634 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms