Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI3P19429 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms