Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF3P18847 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF3P18847 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF3P18847 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF3P18847 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms