Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPI1P17947 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPI1P17947 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms