Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGA1P17096 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms