Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF3P17036 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms