Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms