Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD44P16070 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD44P16070 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD44P16070 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD44P16070 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD44P16070 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD44P16070 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms