Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNT1P13805 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms