Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL11A1P12107 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms