Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODC1P11926 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ODC1P11926 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ODC1P11926 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODC1P11926 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODC1P11926 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODC1P11926 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms