Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2AP11388 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms