Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI2P10070 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI2P10070 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI2P10070 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI2P10070 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI2P10070 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI2P10070 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI2P10070 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI2P10070 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI2P10070 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLI2P10070 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GLI2P10070 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms