Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms