Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM200BP0CF97 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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