Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00869P0C866 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00869P0C866 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms