Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB7P09629 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms