Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF1RP07333 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSF1RP07333 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms