Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPBP07199 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPBP07199 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms