Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA4P05014 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms