Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms