Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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CLDN9O95484 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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