Protein–RNA interactions for Protein: O95406

CNIH1, Protein cornichon homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1O95406 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH1O95406 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms