Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECM2O94769 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms