Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBOX1O75936 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBOX1O75936 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms