Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF253O75346 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF253O75346 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF253O75346 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF253O75346 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF253O75346 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms