Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DTNBO60941 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DTNBO60941 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DTNBO60941 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DTNBO60941 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTNBO60941 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms