Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPLO60437 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPLO60437 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPLO60437 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPLO60437 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPLO60437 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPLO60437 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms