Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH6O60337 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms