Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EDIL3O43854 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EDIL3O43854 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms