Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALUO43852 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALUO43852 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALUO43852 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALUO43852 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALUO43852 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALUO43852 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms