Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms