Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH3O43739 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms